做第三代试管婴儿前需要夫妻双方全面的检查的，女方性激素6项、卵泡的检查、男方精子精液方面的检查等，之后再进入周期开始试管助孕，前期流程与一代、二代试管是一致的，后期会增加一步胚胎筛查。大致流程步骤可分为5步，首先完善双方的检查、制定方案、胚胎培养、胚胎基因筛查，最后是移植。
第三代试管婴儿的主要过程是先把精子和卵子取出来结合形成受精卵，受精卵培养形成胚胎，之后把胚胎里的细胞提取出来检测基因和染色体，观察是否有遗传性疾病，没问题的情况下在把胚胎放入子宫里面去。这也是目前最适合做试管婴儿有遗传性疾病人群的方式。
染色体异常，做第三代试管婴儿是很合适的选择，第三代试管婴儿技术并不是比第一代和第二代先进，只是针对的群体不同，第三代试管婴儿技术是可以针对有明确的基因遗传病患者，减少新生儿携带致病基因的几率。
第三代试管婴儿的大部分步骤和常规试管婴儿较为类似，整体可以分为5个步骤，具体操作内容如下：
1.做第三代试管婴儿是需要满足一定条件的，所以在前期夫妻双方是需要进行全面检查的，检查之后按医嘱定制方案调理身体；
2.确定可以做第三代试管后，会依照定制的方案进行促排卵，一般10多天左右，同时男方需要进行取精，与卵子结合形成受精卵；
3.得到胚胎后需要进行体外培养，到第5-6天时，取细胞进行检测确定是否携带致病基因；
4.医生会根据健康囊胚的发育能力和孕妈状态选择移植的胚胎；
5.在做完试管婴儿后的14天后要抽血检查是否受孕成功。
做第三代试管婴儿，整体耗费的时间大概在2-3个月，费用需要5-8万元左右，因个人的体质不同，费用会有一定的差异。
第三代试管婴儿就只比平常试管婴儿多了两个步骤，第一个是胚胎活检，用于从胚胎上取下细胞用于检测，需要特殊的激光打孔仪、特殊培养皿以及特定的试剂；第二个是对取下的细胞进行诊断，目前常用的是荧光原位杂交和基因芯片技术，两种技术都需要用进口试剂及耗材，因此第三代试管婴儿价格会更加昂贵。
做第三代试管婴儿，孕妇年龄和获得胚胎数量的多少是影响成功率的关键因素，第三代试管婴儿的对象往往是遗传病、反复自然流产、平衡易位等患者，通常年龄偏大，获得胚胎数量较少，通过筛选后健康的胚胎更少，因此第三代试管成功率是不如平常试管的，但一旦妊娠，其流产率是非常低的
